御祭神は、菊理姫命(くくりひめのみこと)、伊弉諾命(いざなぎのみこと)、伊弉冊命(いざなみのみこと)。
東京十社のひとつ。
９４８年に加賀国一之宮の白山比�盗_社から勧請され、現在の本郷元町に創建されたとある。１３３８年には足利尊氏により国家平安御祈願所に命ぜられる。()

１６１６年２代将軍秀忠の命により巣鴨原（現在の小石川植物園内）へ遷座、１６５５年５代将軍綱吉が舘林藩主時代に白山神社を現在の地に移転させ、跡地に小石川御殿（白山御殿）を造営した。綱吉の死後、御殿は廃され、貞享年間（１６８４〜８８）に小石川薬園が置かれた。現在は東京大学の付属施設である小石川植物園となっている。
またその縁で綱吉とその母桂昌院の崇敬を受け、以降、徳川将軍家から信仰された。明治初期には准勅祭社に指定された。
毎年６月には境内にさまざまなあじさいが咲き乱れ「文京あじさいまつり」の会場として大勢の観光客が訪れる。()

（左上）関東松尾神社　江戸時代に白山神社の境内地に京都嵐山松尾大社の分霊を勧請した。
１９５３年（昭和２８年）に酒類関係業者により、老朽化した社殿を改修し盛大に遷座祭を行う。()