御祭神は品陀和気命(ほんだわけのみこと)（応神天皇(おうじんてんのう)）、息長帯姫命(おきながたらしひめのみこと)（神功皇后(じんぐうこうごう)）、玉依姫命(たまよりひめのみこと)（姫神(ひめかみ)）と他に合祀祭神十一柱。
日向之国七福神の恵比須神を奉祀。

７５０年に豊前国宇佐八幡宮を勧請したもので、当時国司や軍司の崇敬も深く、社領を加増せられた７５８年、当山最も興隆を極め、「今最も栄える山」という意味で、社号を「今山」と改め今山八幡宮と号したといわれている。
土持氏から内藤氏に至る歴代藩主が延岡領内守護の神社として厚く崇敬し、代々の領主の祈願所であった。()

明治時代の神仏分離以降は県内外からの参拝者も多く、県北第一の大社として崇敬の念を集め、さらに末社の今山恵比須神社の例祭も「延岡十日えびす」として県内外から多くの参拝者で賑わっている。()

徐福伝説　当地今山は蓬莱山とも呼ばれ、その麓は大古太平洋の白波が寄せる浜であったという。紀元前２２０年頃、秦の始皇帝の命を承けた徐福(じょふく)は蓬莱山にあるという不老不死の薬草を求めて中国から渡海しこの浜に到り、渚にあった徐福岩に船をつないで上陸したと伝えられる。徐福は神仙方術(しんせんほうじゅつ)の第一人者であり、医・工・農などの工人多数を伴って来たことから大陸の文化が初めて日本に入ったのはこの地であったといわれる。()