天台宗。本尊は馬頭観音菩薩。
篠栗四国八十八ヶ所霊場第１５番札所。札所本尊は薬師如来。
１９５０年（昭和２５年）に第８７番札所弘照院初代智亮師の弟子だった城戸亮賢師が開創。()

寺名の妙音寺は琵琶が取り持つ縁で、初代の亮賢師が福岡市にある盲僧琵琶の総本山臨江山成就院の旧寺名の妙音寺をいただき、玄清法流系の天台寺院となる。
もともと第１５番札所薬師堂（１９１７年創設）は第１８番札所篠栗恩山寺近くの小川の畔にあったが、守堂者が高齢となり後継者がいなかったので１９９５年（平成７年）に妙音寺に移された。()