御祭神は初代天皇・神武天皇（神日本磐余彦天皇(かむやまといわれひこのすめらみこと)）を主祭神に、相殿には左に御父君鵜葦草葺不合尊(うがやふきあえずのみこと)、右に御母君玉依姫命(たまよりひめのみこと)が祀られている。()

神武天皇が初代天皇に即位するまでは、神日本磐余彦天皇(かむやまといわれひこのすめらみこと)、幼名を狭野命(さののみこと)と言った。天照大御神から５代目の孫にあたり、鵜葦草葺不合尊(うがやふきあえずのみこと)（鵜戸神宮ご祭神）の第４皇子で、母は玉依姫命(たまよりひめのみこと)。生まれは宮崎県西諸県郡高原町に大字狭野と言われ、この地には狭野神社（旧宮崎神宮別宮）が鎮座している。
神日本磐余彦天皇(かむやまといわれひこのすめらみこと)が４５歳のときに天下統治に相応しいところを求めて日向の国を出発し、大和地方を平定し第１代の天皇として即位された。()

神宮創建は、神武天皇の孫にあたる健磐龍命(たけいわたつのみこと)（熊本・阿蘇神社ご祭神）が九州の長官に就任した際、祖父の遺徳をたたえるために鎮祭したのが始まりと伝えられている。その後、第１０代崇神天皇、第１２代景行(けいこう)天皇の熊襲(くまそ)征討の際に社殿の造営があった。()

御神幸祭（神武さま）
行列の歴史は古く武家時代からあったといわれるが、１８８０年（明治１３年）に現在の宮崎市中村町の氏子総代が「渡御の儀の願い」を提出し、旧暦の３月１５日から４月９日までの２５日間にわたって中村町に御駐輦（神輿が滞在すること）するようになった。この時から御鳳輦(ごほうれん)（神輿のこと）が大淀川を越えるようになり、１９０９年（明治４２年）に御鳳輦が新調されたのをきっかけに現在のように隊列を組むようになった。()

（左下）プロ野球読売巨人軍がシーズン前キャンプで宮崎入りすると、宮崎神宮に立ち寄り必勝祈願をしていく。()

（上）オオシラフジ（国指定天然記念物）　中国原産でわが国では最も大きい樹木である。「オオシラフジ」は正式な学名でなく、フジの一品種で白く大きな花をつけることからその名が呼ばれている。()