法相宗大本山。西国薬師四十九霊場第１番札所、神仏霊場奈良１２番。
６８０年天武天皇により発願、６９７年持統天皇によって本尊開眼、文武天皇の御代に至り飛鳥に堂宇が完成、７１０年平城遷都で現在地に移る。南都七大寺の一つにも数えられて隆盛したが、のちに兵火や天災で伽藍の大半を失い、東塔だけが奇跡的に現在まで伝わる。
１９６７年、高田好胤管主(たかだこういんかんす)により薬師寺白鳳伽藍の復興が発願され、翌年から始められた写経勧進で、金堂、西塔、中門、回廊、さらには２００３年３月に大講堂が復興された。
また境内では随時、僧侶による笑いを交えた法話が開催され、一つの名物になっている。

（左上）西塔(さいとう)　１５２８年（享禄元年）に兵火で焼失し、１９８１年（昭和５６年）４月に４５３年ぶりに創建当初の白鳳様式をもって復興。
（右上）東塔(とうとう)　国宝・白鳳時代。
各層に裳階があるため六重に見えるが、実際は三重塔。この特異な形が、全体として律動的な美しさを保ち、米国の東洋美術研究家フェノロサは「凍れる音楽」と賞賛した。

（左上）金堂(こんどう)　１９７６年の復興。重層入母屋造で各階に裳階(もこし)が付くため、実際は２階建だが４階建のように見える壮麗なお堂。龍宮造と呼ばれ、屋根の両端には金色の鴟尾(しび)が輝いている。
金堂には、国宝の薬師三尊像が安置されている。中央に本尊である薬師如来坐像、向かって右に日光菩薩、左に月光(がっこう)菩薩が立つ。
（右上）大講堂(だいこうどう)　金堂の北側に２００３年（平成１５年）に復興。正面４１ｍ、奥行２０ｍ、高さ１７ｍあり、伽藍最大の建造物。大講堂の本尊には弥勒三尊像（重要文化財・白鳳時代）、後堂(うしろどう)には仏足石・仏足跡歌碑（国宝・天平時代）が安置されている。

（左上）玄奘三蔵院伽藍(げんじょうさんぞういんがらん)　法相宗の祖、玄奘三蔵(げんじょうさんぞう)（三蔵法師）の遺徳を顕彰するため１９９１年（平成３年）に建立された。伽藍中央の玄奘塔に玄奘の舎利を奉安し、背後の大唐西域壁画殿には平山郁夫が３０年かけて描いた「大唐西域壁画」が安置されている。