金峯山修験本宗。山号は国祐山(こくゆうざん)。本尊は金剛蔵王大権現。
九州四十九院薬師霊場第３９番札所。()

創建は１８８０年（明治３６年）頃に法真和尚が比叡山で修行の後、長崎に庵を建てたのが始まり。その後１９３２年（昭和７年）頃、伊万里市界隈に疫病が流行したとき、当時の町長が１２代片桐法師の験力を頼って要請し、別院道場を設けたのが現在の当寺の始まり。
長崎市は悲惨な原爆で壊滅し、もとの妙法院は焼失し、伊万里の別院道場に法灯を再興して妙法院と号した。()