高野山真言宗。山号は摩尼山(まにさん)。
本尊は不動明王立像。九州八十八ヶ所百八霊場第２６番札所。
明暦年間（１６５５〜５８年）宥雄上人の開山と伝え、府内松平家の祈願寺として繁栄した。藩主松平忠昭は当時、中津留に屋敷を構えており、福寿院も屋敷の裏鬼門にあたる南西に創建された。
１６５８年忠昭が府内城主に転封されると、当寺は城内三の丸に移転した。現在地に移ったのは１８７０年（明治３年）のことである。()

本尊の不動尊は鎌倉時代末期の作とされ、丹波国篠山から伝えられたという。その他に弘法大師像や阿弥陀如来像、護摩壇には藩主の念持仏だった不動尊を安置する。()

石田三成の妹婿にあたる福原直高が１５９７年に府内城（白雉城(はくちじょう)）の前身を築いた。
当時、この辺りは大分川の河口にあったため、天守閣の定礎を固めるたびに水が出て工事が中断した。そこで厄除のため人柱を立てることとなり、上野六坊に住んでいた１８歳のお宮が選ばれた。お宮は母親と二人暮らしで貧しく、母親には５０石の扶持が毎年与えられると聞かされ、人柱になる決心をした。３日間の施餓鬼の末、城の守護神の弁財天を抱き、３月１８日に入水、人柱になったといわれる。それ以降は天守閣造営の工事が順調に進み、完成することができた。
お宮の霊は弁財天とともに、府内城の鎮守として祀られ、３月１８日から２０日までと９月１９日の城まつりの折に廻向されていた。１８６３年頃幕末の混乱期から一時中断していたが、戦後になって復活した。現在は３月１８日から２０日までの３日間、城址公園天守閣下のお宮の墓前とお宮の位牌を祀る福寿院で追善廻向が修されている。()