真言宗善通寺派の大本山。京都十三佛霊場第１１番札所、真言宗十八本山霊場のひとつ。
９９１年に弘法大師より８代目の弟子にあたる仁海(にんかい)僧正(そうじょう)が創建した。()

もとの名は牛皮山(ぎゅうひざん)曼荼羅寺(まんだらじ)といい、その名の由来は、ある夜に亡き母が牛に生まれ変わっている夢を見た仁海(にんかい)僧正(そうじょう)が、その牛を探し求めて世話を尽くしたものの間もなく死んだため悲しみ、その牛の皮に両界曼荼羅の尊像を描いて本尊にしたことによる。()

その後、第五世増俊(ぞうしゅん)が曼荼羅寺の塔頭として隨心院を建立し、第七世親厳の時に後堀河天皇より門跡の宣旨を受け 、門跡寺院となった。()

この附近は、小野小町の旧跡と伝えられ、境内には小町に寄せられた多くの恋文を埋めたという小町文塚や、化粧の井戸などがある。()

また梅の美しい寺としても有名で、毎年３月の最終日曜日には、小野小町に恋した深草少将の百夜通いの悲恋伝説を主題とした「はねず踊り」（はねずとは梅花の薄紅色のこと）が催される。()