高野山真言宗。山号は立護山。本尊は毘沙門天王。
九州三十三観音霊場第１６番札所。
鎌倉幕府の執権北条時頼の弟・北条時定は弟・定宗、嫡子・随時(ゆきとき)一門を同道して阿蘇小国の地頭として当郷に下向し、元寇祈願のため形勝の地として当山を選んだ。ここは九州の中央部で要害堅固の地、自然湧出の温泉のあるところで、そのむかし弘法大師が霊場を開き、鎌倉時代梶原氏が築く庭園のある縁故の地であった。そして勅宣を蒙り、１２７４年（文永１１年）山城国醍醐寺三宝院の経杲(きょうこう)大僧正を招き、五坊（別当坊多門院、密教坊密条院、中ノ坊祭蔵院、西ノ坊極楽院、北ノ坊理趣院）を建て満願寺と総称した。()

北条時定は鎮西奉行として筑前姪ヶ浜に於て、文永・弘安の役では三軍の将となりて元寇を防ぎ、三代にわたり鎮西奉行を務めた。
その後、孫・治時(はるとき)の時代に鎌倉幕府は滅びて北条一門跡を絶つ。治時(はるとき)は満願寺境内に父祖の廟を営み五輪の石塔を建てる。現在満願寺小学校の運動場に面するところにある。
その後、南朝後村上天皇より１３５６年６月１２日、祈願精誠いたすべき旨の綸旨を賜いて穀田を寄付せられ、阿蘇大宮司宇治惟時(これとき)、境を検地して付属した。御綸旨二通並に大宮司避状は今なお現存する。
そして、戦国時代は阿蘇惟豊(これとよ)、ついで豊後国の大友氏から保護されるが、１５８７年に起きた肥後国衆一揆の影響で多門院のみが残り、現在の満願寺となる。()

北条三代の墓に隣して地蔵堂がある。１３６７年の建立と年代記に記され、本尊地蔵菩薩は身高２ｍ６５ｃｍの大木彫仏で立像の柔和な線は南北朝時代を偲ばせるものがある。
地蔵堂の東隣りに１５４６年竹田の番匠が立てたと伝える大師堂があったが、明治時代の廃仏毀釈により取り壊され、本尊弘法大師像は１９２３年（大正１２年）満願寺創立６５０年祭記念建立の大師堂に祀られている。
１５７１年に仁王門（山門）が建ったと記録がある。現在の山門は１９２９年（昭和４年）に建てられたもの。()