肥後国一之宮。延喜式名神大社。全国阿蘇神社の総本社。
第７代孝霊天皇の御代（紀元前２８１年）の創祀とされる。()

ご祭神は阿蘇十二神、すなわち
一宮　健磐龍命(たけいわたつのみこと)（神武天皇の孫）
二宮　阿蘇津姫命(あそつひめのみこと)（健磐龍命(たけいわたつのみこと)の妃）
三宮　日子八井命(ひこやいのみこと)（二宮の父・草部吉見神(くさかべよしみのかみ)・國龍命・神武天皇の子）
四宮　比�東芬q命(ひめみこのみこと)（日子八井命(ひこやいのみこと)の妃）
五宮　彦御子命(ひこみこのみこと)（速瓶玉命(はやみかたまのみこと)の子）
六宮　若比�当ｽ(わかひめのみこと)（彦御子命(ひこみこのみこと)の妃）
七宮　新彦命(にひひこのみこと)（日子八井命(ひこやいのみこと)の子）
八宮　新比�当ｽ(にひひめのみこと)（新彦命(にひひこのみこと)の娘）
九宮　若彦命(わかひこのみこと)（新彦命(にひひこのみこと)の子・新比�当ｽ(にひひめのかみ)の弟）
十宮　彌比�当ｽ(やひめのみこと)（新彦命(にひひこのみこと)の妃）
十一宮　國造速瓶玉命(くにのみやつこはやみかたまのみこと)（健磐龍命(たけいわたつのみこと)の子）
十二宮　神渟名川耳命(かむぬなかはみみのみこと)（綏靖(すいぜい)天皇・神沼河耳命・神武天皇の子）
と別殿に延喜式(えんぎしき)に記す全国３１３２座の神を祀る。
この中でも一宮の神武天皇の孫神である健磐龍命(たけいわたつのみこと)、二宮の一宮御妃神である阿蘇津姫命(あそつひめのみこと)、十一宮の阿蘇初代の国造である國造速瓶玉命(くにのみやつこはやみかたまのみこと)は他の神より重く祀られ、陵墓といわれる古墳が当社より３Ｋｍほど離れた地点に点在している。()

社伝によれば、健磐龍命(たけいわたつのみこと)は神武天皇の特命を受けて九州鎮護の任にあたり、当時大湖水であった阿蘇火口湖の水を切って落とし美田を開き、住民に農耕の道を教え国土の開拓に尽くしたといい、その子速瓶玉命(はやみかたまのみこと)によって孝霊天皇の代に祀られたのが本社の創建という。
古来朝廷の崇敬厚く、８５９年に正二位、延喜の制で名神大社とされ、１０１７年には一代一度の大奉幣(だいほうべい)にあずかる。()

２００７年（平成１９年）には、神殿や楼門などの社殿が国の重要文化財に指定されたが、２０１６年（平成２８年）４月の熊本地震で楼門と拝殿が倒壊、神殿も破損した。()

広大な社領をもち、中世は武将に崇敬され、南北朝の争乱期に大宮司家が活躍したが、豊臣秀吉に社領を没収され、往時の勢いは衰えた。１９１４年（大正３年）に官幣大社となる。創建以来、祭神の子孫阿蘇大宮司が奉仕し現在に至っている。()