主祭神は大日霊貴命(おおひるめむちのみこと)（天照大御神の別名）で、相殿に天忍穂耳命(あめのおしほみみのみこと)、天穂日命(あまのほひのみこと)、天津日子根命(あまつひこねのみこと)、活津日子根命(いくつひこねのみこと)、熊野久須毘命(くまのくすびのみこと)、多紀理毘売命(たきりひめのみこと)、狹依日売命(さよりひめのみこと)、多岐津比売命(たきつひめのみこと)を祀る。
社記によれば、天智天皇が薩摩地方御臨幸の折り、当地の大社に御滞興あらせられた由緒の地として、７０６年に堀内氏、指宿氏の遠祖が勅を奉じて、天皇の神霊、遺器を奉斎して葛城宮が創建された。その後の８７４年に開聞岳の大噴火にて、開聞九社大明神（現在の枚聞神社）の葛城宮に御避難されたいとの御神託により遷宮、噴火が終息して枚聞神社は現在の場所に遷座し、以来当杜は開聞新宮九社大明神として奉斎し、指宿の総氏神として地方開拓の祖神、交通航海安全、諸業繁栄の守護神として崇敬せられ、明治維新に際し揖宿神社と改称され現在に至る。()

現在の社殿は１８４７年に第２７代薩摩藩主島津斎興(しまづなりおき)公により改築されたもので、入母屋造の本殿を始め、勅使殿・摂社に至るまで、全てに楠材が使用されている。本殿・弊殿・舞殿・拝殿・勅使殿が連結して一体の建造物となっており、舞殿と勅使殿の格天井には１２６枚と６４枚の荘厳な花木絵が描かれている。()