真言宗御室派。山号は金剛勝山。本尊は阿弥陀如来坐像。
九州八十八ヶ所百八霊場第６３番札所。
真言八祖の龍猛(りゅうみょう)菩薩が渡来（インド仏教の僧）。能古見(のこみ)庄の山上に、天然の岩窟に如来石という石があることを知り、麓に林庵を建立して石を礼拝したという。８０４年に弘法大師が入唐の前に林庵で修行をし蓮厳院と号した。のち１１２１年に興教大師が再建する。()

１１５８年に後白河天皇が一国一伽藍の創建を発願し、当地には慶照上人を開基として金剛勝院を建立、蓮厳院はその一院となる。しかし、永禄年間（１５５８〜７０年）大友宗麟の兵火で焼失して蓮厳院のみとなった。現在、蓮厳院が建っているのは金堂の跡といわれ、隣接して鎮守だった八幡神社がある。
本堂の背後には宝形造で白亜の収蔵庫がある。中央に大きな阿弥陀如来、左にもう一体の阿弥陀如来、右は薬師如来を安置し、いずれも藤原時代の作で国指定重要文化財。
２０１７年（平成２９年）に本堂は葦葺きの屋根を重厚な雰囲気の瓦屋根に改修した。()